日本列島の大半が海中に沈んだ世界で海上の保安を担う職業「ブルーマーメイド」 その養成学校に入学した女子生徒たちの活躍を描いています。 主人公は教育艦「晴風（はれかぜ）」の艦長 岬明乃（みさきあけの） 海難事故で両親を失った明乃は仲間や家族への思い入れが非常に強く、本来の艦長の仕事を放り出して仲間の救助に向かう。そんな明乃と副長の宗谷ましろ（むねたにましろ）は度々衝突するが、ある事件を切っ掛けに次第に「晴風」の家族としての絆が生まれていきます。 物語は海洋実習で航行中の「晴風」が指導教官の艦船から砲撃を受ける場面から動きだします。
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